坊間有各種電子發票加值中心推薦的方案，但不同的電子發票收費方案令人眼花撩亂，在眾多選擇中，企業只要掌握下列幾項原則，就能找到符合自家企業經營型態的電子發票服務。
依照B2B、B2C需求不同 選擇適用的發票方案
電子發票方案的選擇，與企業本身的經營型態息息相關，如果主要是B2B（Business to Business）的經營型態，也就是買受人主要為公司行號的話，在開立發票時就必須標注買方統編。像這樣的電子發票未必需要列印紙本，只要透過電子郵件寄送發票電子證明聯檔案給買方公司即可。
但如果公司的經營型態主要屬於B2C（Business to Customer），也就是買受人主要是一般消費者，就不需要在發票上標注統一編號。由於這類發票可以對獎，為確保發票不會重覆開立，除非直接存入買方指定載具，否則就必須將發票列印出來，由消費者自行保存，一旦中了獎，中獎人必須持發票正本才能兌領獎金。像這樣的企業或店家，就要考慮選用有感熱機可以列印熱感紙電子發票證明聯的方案。
電子發票系統是否需要與公司既有系統串接
有些公司在規劃開立電子發票時，會需要與內部既有的ERP或POS系統串接，例如規模較大，或是過去使用電子計算機發票的公司，像這類型的企業在開立電子發票時，就需要選擇能夠提供客製化服務的電子發票加值服務中心。
關網資訊為財政部核可的電子發票加值服務中心，至今所服務過的客戶中，就有不少需要跟企業既有ERP系統串接的客戶，無論是每個月開立數十張，甚至每個月開立多達數百萬張電子發票的企業，關網資訊都可依照客戶的專屬需求，提供量身打造的電子發票系統。
每月開立發票張數是選擇方案的重要指標
如果企業開立電子發票的需求單純，不需要與其他系統串接，那麼就可以依照每個月發票開立的數量，做為選擇合適加值中心及服務方案的參考指標。
目前坊間多數的加值服務中心所推出的電子發票服務方案，是以每個月發票開立張數做為計費標準，常見的方案內容是每月支付數百元到數千元不等的服務費，讓用戶每個月開立一定數量的電子發票。以關網資訊的「雲端型」方案為例，每個月開立250張發票內，最低月服務費只要200元。
不過有些公司行號因為行業特質，大小月或淡旺季的落差很明顯，因此有時候可能一個月開不到幾張發票，但也許下個月卻要開立數百張發票。對於這種性質的公司行號，關網資訊也特別推出「年結型」方案，用戶只要年繳2,400元，就可以在一年內隨時開立2,400張發票，淡季、小月時沒用到的發票額度，可以挪到旺季、大月時再用，如果生意興隆，一年2,400張的發票不到一年就開完了，只要再續約就可以繼續開立電子發票。